Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Syde1Q9DBZ9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syde1Q9DBZ9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Syde1Q9DBZ9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Syde1Q9DBZ9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syde1Q9DBZ9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Syde1Q9DBZ9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syde1Q9DBZ9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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