Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtr1Q9DBC3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms