Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccdc89Q9DA73 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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