Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ift43Q9DA69 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms