Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms