Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc81Q9D5W4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms