Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc7Q9D541 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc7Q9D541 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms