Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PrameQ9D4Z5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PrameQ9D4Z5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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PrameQ9D4Z5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrameQ9D4Z5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms