Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cfap53Q9D439 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms