Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Krt20Q9D312 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Krt20Q9D312 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Krt20Q9D312 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Krt20Q9D312 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt20Q9D312 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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