Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PmpcbQ9CXT8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms