Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ist1Q9CX00 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ist1Q9CX00 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ist1Q9CX00 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ist1Q9CX00 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ist1Q9CX00 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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