Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms