Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CQC3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q9CQC3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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