Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms