Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp11Q99K46 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp11Q99K46 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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