Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ctu1Q99J10 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ctu1Q99J10 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ctu1Q99J10 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctu1Q99J10 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Ctu1Q99J10 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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