Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc6a20aQ8VDB9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc6a20aQ8VDB9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms