Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trip10Q8CJ53 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms