Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Colec10Q8CF98 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Colec10Q8CF98 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Colec10Q8CF98 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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