Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ccdc17Q8CE13 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc17Q8CE13 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc17Q8CE13 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ccdc17Q8CE13 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ccdc17Q8CE13 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc17Q8CE13 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc17Q8CE13 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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