Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms