Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pnma1Q8C1C8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pnma1Q8C1C8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pnma1Q8C1C8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pnma1Q8C1C8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pnma1Q8C1C8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pnma1Q8C1C8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pnma1Q8C1C8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pnma1Q8C1C8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pnma1Q8C1C8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma1Q8C1C8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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