Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod1Q8BVA4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms