Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco3Q8BH01 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmco3Q8BH01 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms