Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc17a8Q8BFU8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms