Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ChfrQ810L3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms