Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcsk9Q80W65 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms