Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll4Q80UG8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttll4Q80UG8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms