Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl2Q78Y63 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms