Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smchd1Q6P5D8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms