Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Fndc3c1Q6DFV6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Fndc3c1Q6DFV6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Fndc3c1Q6DFV6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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