Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ric1Q69ZJ7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ric1Q69ZJ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms