Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zcchc2Q69ZB8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zcchc2Q69ZB8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms