Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pkp4Q68FH0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pkp4Q68FH0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pkp4Q68FH0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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