Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Grik1Q60934 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Grik1Q60934 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Grik1Q60934 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Grik1Q60934 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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