Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms