Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc88aQ5SNZ0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms