Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc3lQ4KL14 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms