Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Samd5Q3V1H9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Samd5Q3V1H9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms