Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ckap2Q3V1H1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms