Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ulk4Q3V129 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms