Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc4Q3UP24 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nlrc4Q3UP24 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nlrc4Q3UP24 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms