Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxosQ3UL53 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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