Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trafd1Q3UDK1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms