Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cops9Q3U898 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms