Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gse1Q3U3C9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gse1Q3U3C9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gse1Q3U3C9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms