Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc174Q3U155 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc174Q3U155 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms