Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rufy4Q3TYX8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms