Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms